La Organización Internacional de Energía Atómica (OIEA), está involucrada en el Proyecto por su capacidad técnica e institucional para el desarrollo de los estudios isotópicos naturales del Acuífero Guaraní, en base de los isótopos que se encuentran en forma natural en el ambiente, como ayuda a la comprensión de los orígenes, edades, flujos y relación de ellos con los recursos hídricos.